Pertama ada mengamuk Meicoomon, dan kemudian reboot akhirnya terjadi. Taichi dan teman-temannya meninggalkan Meiko di belakang dalam kesedihannya, dan menuju Dunia Digital. Mereka bersatu kembali dengan pasangan mereka Digimon, yang telah kehilangan semua ingatan mereka hingga saat ini. Meski begitu, DigiDestined memutuskan untuk menjangkau dan membangun kembali ikatan tersebut, dan Digimon mereka merespons dengan cara yang sama. Satu-satunya pengecualian adalah Biyomon, yang secara terbuka waspada bahkan setelah digivolving ke panggung Rookie-nya … ‘Sudah kubilang, aku tidak tahu apa-apa tentang’ masa lalu ‘! lebih mencurigakan. Ini membuat Sora tertegun dan terluka, dan Taichi dan Yamato bingung apa yang harus dikatakan padanya. Ketika semua orang membahas apa yang harus mereka lakukan dari sini di Dunia Digital, Meicoomon tiba-tiba muncul dan kemudian menghilang. Untuk beberapa alasan dia masih memiliki ingatannya, saat dia berkeliaran dengan air mata di matanya, mencari Meiko. Melihat ini memperkuat tekad anak-anak untuk melakukan perjalanan melalui Dunia Digital untuk menyelamatkan Meicoomon. Tapi kemudian di depan mata mereka muncul pria yang telah bersama para Master Kegelapan. Sementara di dunia nyata, Nishijima menerima kabar bahwa Himekawa telah hilang. Ketika dia menyelidiki, dia menentukan bahwa ada beberapa agenda tersembunyi di balik perilakunya sampai saat ini. Ini ada hubungannya dengan peristiwa di masa lalu yang menentukan nasib mereka … Petualangan sekarang berkembang sekali lagi …