Liones Yelistratova, seorang putri murni dari sebuah negara kecil, memasuki sebuah sekolah di Hokkaido pada hari musim semi. Sekolah adalah lembaga pendidikan khusus yang dioperasikan oleh ALCA untuk melatih ahli logika, yang menjaga perdamaian dunia. Liones memasuki kelas S, di mana dia bertemu banyak teman sekelas dengan kepribadian unik, seperti Nina. Kehidupan sehari-hari yang hidup dan imut dimulai sekarang.