Setelah berjuang untuk membebaskan permainan sepak bola di Jepang dari Sektor Kelima, pasukan sepak bola negara itu sekali lagi dapat berharap untuk melangkah ke lapangan. Namun, tantangan baru akan muncul untuk para pemain Jepang dalam bentuk Football Frontier International Vision 2, sebuah turnamen baru yang akan mempertemukan tim-tim terbaik yang dapat dikumpulkan oleh masing-masing negara. Tenma Matsukaze dan rekan satu tim Raimon-nya, Takuto Shindou dan Kyousuke Tsurugi, adalah sekali lagi bagian dari tindakan karena mereka telah dipilih untuk bermain untuk perwakilan Jepang, Inazuma Jepang. Sangat mengejutkan mereka, pelatih memilih delapan pemain lain yang tidak memiliki pengalaman sebelumnya bermain sepak bola! Tim Inazuma Jepang akan memiliki gunung besar untuk didaki, membangun kimia dan keterampilan saat mereka berjalan. Apa yang mereka tidak tahu adalah bahwa turnamen akan mengatur panggung untuk sesuatu yang jauh lebih besar, sesuatu dari dunia ini di Inazuma Eleven Go: Galaxy!