Otaku yang kejam, Kirino Kousaka, telah kembali dan hidup kembali di Jepang bersama teman dan keluarganya. Terlepas dari apa yang kakak laki-lakinya, Kyousuke, sebelumnya lakukan untuknya, Kirino terus memberinya bahu dingin, yang membuatnya frustrasi. Dia khawatir bahwa bujukannya bagi Kirino untuk meninggalkan latihan dan lintasan lapangannya di Amerika dan kembali ke rumah mungkin telah sangat menegangkan hubungannya dengan dia. Selain itu, Kyousuke sekarang juga harus men-decode pesan yang berani dan samar dari Ruri ‘Kuroneko’ Gokou, juniornya di sekolah dan juga teman Kirino. Ketika hubungan antara kedua saudara kandung dan teman-teman mereka semakin dalam, Kirino dan Kyousuke akan segera harus mencari tahu bagaimana mereka ingin berurusan dengan hubungan ini, saling membantu mewujudkan perasaan mereka sendiri dalam proses tersebut. Terlepas dari itu, Kirino masih berhasil menemukan waktu untuk memuaskan kebutuhan otaku dengan ditemani saudara laki-lakinya.