Ini adalah Film ke-6. Satoshi, Haruka, Takeshi, dan Masato datang ke festival Wishing Star of Seven Nights. Selama kesenangan mereka, pokemon legendaris, Jirachi, melayang dari surga dan berteman dengan Masato. Jirachi, dengan kekuatan untuk mengabulkan keinginan apa pun, dicari oleh banyak orang yang ingin mengklaim kekuatannya. Seorang pria berusaha menggunakan kekuatan legendarisnya untuk menghidupkan kembali pokemon kuno yang dikenal sebagai Groudon, tidak menyadari bahaya yang tersembunyi di dalam kekuatan Jirachi.