Semua orang di dunia menggunakan aplikasi ponsel cerdas. Tapi di dalamnya mengintai makhluk tak dikenal yang disebut ‘Appli Monsters,’ atau ‘Appmon.’ Appmon adalah bentuk kehidupan AI dengan kemampuan untuk berpikir dan bertindak, dan ada dalam batas antara dunia manusia dan ruang digital. Di lautan internet yang luas, ‘bos terakhir AI’ Leviathan mengambil kendali atas Appmon dengan virus dan mulai meretas setiap sistem, sehingga mulai mengendalikan dunia manusia dari dunia internet. Haru Shinkai dipimpin untuk mendapatkan Appli Drive, dan menggunakannya untuk mewujudkan Gatchmon, monster aplikasi pencarian.