Suatu hari, sebuah kota tiba-tiba menghilang. Takuya, kurir kontrak profesional dan satu-satunya serigala, bertemu Yuki, satu-satunya yang selamat dari kepunahan kota. Keduanya mengandalkan pesan dari ayah Yuki, yang terdengar hilang, dan menuju ke kota yang hilang, Lost. Namun, rintangan tak terduga menyerang sebelum pasangan, dengan kenyataan terutama mengejutkan bagi Yuki. Di depan mereka ada perasaan orang-orang yang tertinggal, kelompok misterius yang memanipulasi bayang-bayang, dan mengungkap konspirasi tersembunyi. Takuya dan Yuki, yang keduanya awalnya adalah orang asing, akan memperdalam ikatan mereka selama perjalanan dan mengungkap misteri kota yang Hilang.